La docencia y la investigación son dos de las tareas propias de la Fundación Juan Cuidad en aras a conseguir los objetivos para la que fue creada. Por ello, trata de promover y coordinar desde los centros asistenciales estudios e investigaciones que se relacionan con el campo de las ciencias médicas, sociales y familiares para el mejor conocimiento de los problemas y necesidades que afectan a la población, especialmente la que se halla en situaciones de enfermedad y pobreza, marginación o exclusión. 

Asimismo, con ánimo de colaborar y complementar las tareas de investigación, custodia y difusión realizadas desde los Archivos de la Orden en Roma y Granada, desde 1996 se viene desarrollando un proyecto de investigación sobre fuentes y materiales de la Congregación Española de la Orden Hospitalaria de San Juan de Dios (1495-1934). Ver más en el Portal Juandediano.

La formación e investigación se plantean como una premisas indispensable que no mira hacia otros profesionales, sino que entra a pleno título entre las actividades que pueden ser realizadas y promovidas en los Centros (Cf. Carta de Identidad, 6.3.2).